Речь идет не столько о фильтровании, сколько о стерилизации: ультрафиолет (УФ) убивает большинство вредных для животных бактерий и вирусов, сохраняя полезных микробов, участвующих в «круговороте» азота. Такая обработка рекомендуется для профилактики и лечения некоторых болезней, а также для борьбы с одноклеточными водорослями. Ультрафиолет излучают специальные лампы. Их мощность зависит от объема обрабатываемой воды. Самих лучей мы не видим, но лампы слегка светятся голубым, так что заметно, включены они или нет.

Ультрафиолет слабо распространяется в воде, поэтому для достижения максимального эффекта она должна быть прозрачной и бесцветной, хорошо отфильтрованной. Лампа довольно быстро перегорает, и менять ее приходится примерно дважды в год.